L'AFSEP se compose de 6 sections régionales, du Club Jeunes et de groupes thématiques et a pour buts :
- de promouvoir les méthodes physico-chimiques de séparation dans tous les domaines d'activité ;
- de contribuer à leur développement et de favoriser les échanges entre personnes des secteurs public et privé qui les conçoivent, les développent, les utilisent et construisent des instruments basés sur elles ;
- de promouvoir la formation initiale et continue en sciences séparatives et l'insertion professionnelle des jeunes diplômés dans cette spécialité.
